Protein–RNA interactions for Protein: Q9H790

EXO5, Exonuclease V, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO5Q9H790 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXO5Q9H790 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXO5Q9H790 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXO5Q9H790 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXO5Q9H790 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXO5Q9H790 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms