Protein–RNA interactions for Protein: Q9H320

VCX, Variable charge X-linked protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCXQ9H320 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCXQ9H320 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms