Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDCL3Q9H2J4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms