Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTDSP1Q9GZU7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms