Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NYXQ9GZU5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NYXQ9GZU5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NYXQ9GZU5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NYXQ9GZU5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NYXQ9GZU5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NYXQ9GZU5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NYXQ9GZU5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NYXQ9GZU5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NYXQ9GZU5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NYXQ9GZU5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NYXQ9GZU5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NYXQ9GZU5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NYXQ9GZU5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
NYXQ9GZU5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NYXQ9GZU5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NYXQ9GZU5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NYXQ9GZU5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NYXQ9GZU5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
NYXQ9GZU5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NYXQ9GZU5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NYXQ9GZU5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NYXQ9GZU5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NYXQ9GZU5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NYXQ9GZU5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NYXQ9GZU5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
NYXQ9GZU5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
NYXQ9GZU5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NYXQ9GZU5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NYXQ9GZU5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NYXQ9GZU5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NYXQ9GZU5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NYXQ9GZU5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NYXQ9GZU5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NYXQ9GZU5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NYXQ9GZU5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NYXQ9GZU5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NYXQ9GZU5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NYXQ9GZU5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NYXQ9GZU5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NYXQ9GZU5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NYXQ9GZU5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NYXQ9GZU5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
NYXQ9GZU5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NYXQ9GZU5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
NYXQ9GZU5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NYXQ9GZU5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NYXQ9GZU5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
NYXQ9GZU5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NYXQ9GZU5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NYXQ9GZU5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NYXQ9GZU5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NYXQ9GZU5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NYXQ9GZU5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NYXQ9GZU5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NYXQ9GZU5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NYXQ9GZU5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NYXQ9GZU5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NYXQ9GZU5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NYXQ9GZU5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NYXQ9GZU5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NYXQ9GZU5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NYXQ9GZU5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NYXQ9GZU5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NYXQ9GZU5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NYXQ9GZU5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NYXQ9GZU5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NYXQ9GZU5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NYXQ9GZU5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms