Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ4

SLC25A39, Solute carrier family 25 member 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39Q9BZJ4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC25A39Q9BZJ4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC25A39Q9BZJ4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC25A39Q9BZJ4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC25A39Q9BZJ4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC25A39Q9BZJ4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC25A39Q9BZJ4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC25A39Q9BZJ4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms