Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms