Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTDSS2Q9BVG9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms