Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NDUFAF3Q9BU61 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms