Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms