Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SYT3Q9BQG1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYT3Q9BQG1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms