Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCF25Q9BQ70 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCF25Q9BQ70 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCF25Q9BQ70 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms