Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP88Q99567 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP88Q99567 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP88Q99567 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP88Q99567 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP88Q99567 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP88Q99567 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP88Q99567 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP88Q99567 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP88Q99567 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP88Q99567 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP88Q99567 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP88Q99567 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP88Q99567 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP88Q99567 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP88Q99567 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP88Q99567 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP88Q99567 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP88Q99567 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP88Q99567 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP88Q99567 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP88Q99567 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP88Q99567 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms