Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMS19Q96T76 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMS19Q96T76 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMS19Q96T76 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MMS19Q96T76 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMS19Q96T76 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMS19Q96T76 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMS19Q96T76 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMS19Q96T76 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMS19Q96T76 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMS19Q96T76 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMS19Q96T76 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMS19Q96T76 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMS19Q96T76 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMS19Q96T76 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMS19Q96T76 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMS19Q96T76 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMS19Q96T76 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMS19Q96T76 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMS19Q96T76 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMS19Q96T76 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMS19Q96T76 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMS19Q96T76 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMS19Q96T76 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMS19Q96T76 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms