Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
RSF1Q96T23 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC43.37■■■■■ 4.53
RSF1Q96T23 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC43.37■■■■■ 4.53
RSF1Q96T23 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
RSF1Q96T23 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
RSF1Q96T23 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
RSF1Q96T23 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
RSF1Q96T23 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC43.36■■■■■ 4.53
RSF1Q96T23 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
RSF1Q96T23 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
RSF1Q96T23 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
RSF1Q96T23 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
RSF1Q96T23 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
RSF1Q96T23 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
RSF1Q96T23 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC43.33■■■■■ 4.53
RSF1Q96T23 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
RSF1Q96T23 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
RSF1Q96T23 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.53
RSF1Q96T23 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
RSF1Q96T23 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.53
RSF1Q96T23 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.52
RSF1Q96T23 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
RSF1Q96T23 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
RSF1Q96T23 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
RSF1Q96T23 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
RSF1Q96T23 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC43.3■■■■■ 4.52
RSF1Q96T23 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC43.3■■■■■ 4.52
RSF1Q96T23 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC43.3■■■■■ 4.52
RSF1Q96T23 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC43.3■■■■■ 4.52
RSF1Q96T23 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
RSF1Q96T23 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
RSF1Q96T23 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC43.29■■■■■ 4.52
RSF1Q96T23 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
RSF1Q96T23 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC43.29■■■■■ 4.52
RSF1Q96T23 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
RSF1Q96T23 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC43.28■■■■■ 4.52
RSF1Q96T23 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
RSF1Q96T23 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
RSF1Q96T23 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
RSF1Q96T23 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
RSF1Q96T23 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
RSF1Q96T23 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
RSF1Q96T23 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
RSF1Q96T23 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC43.27■■■■■ 4.52
RSF1Q96T23 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
RSF1Q96T23 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
RSF1Q96T23 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
RSF1Q96T23 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
RSF1Q96T23 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
RSF1Q96T23 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
RSF1Q96T23 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
RSF1Q96T23 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
RSF1Q96T23 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
RSF1Q96T23 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
RSF1Q96T23 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
RSF1Q96T23 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
RSF1Q96T23 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
RSF1Q96T23 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
RSF1Q96T23 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
RSF1Q96T23 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
RSF1Q96T23 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
RSF1Q96T23 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
RSF1Q96T23 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
RSF1Q96T23 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC43.21■■■■■ 4.51
RSF1Q96T23 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
RSF1Q96T23 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC43.2■■■■■ 4.51
RSF1Q96T23 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
RSF1Q96T23 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
RSF1Q96T23 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC43.18■■■■■ 4.5
RSF1Q96T23 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC43.18■■■■■ 4.5
RSF1Q96T23 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC43.17■■■■■ 4.5
RSF1Q96T23 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC43.17■■■■■ 4.5
RSF1Q96T23 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
RSF1Q96T23 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
RSF1Q96T23 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC43.16■■■■■ 4.5
RSF1Q96T23 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.16■■■■■ 4.5
RSF1Q96T23 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC43.15■■■■■ 4.5
RSF1Q96T23 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
RSF1Q96T23 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
RSF1Q96T23 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
RSF1Q96T23 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
RSF1Q96T23 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
RSF1Q96T23 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
RSF1Q96T23 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
RSF1Q96T23 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.49
RSF1Q96T23 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.12■■■■■ 4.49
RSF1Q96T23 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
RSF1Q96T23 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
RSF1Q96T23 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
RSF1Q96T23 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC43.09■■■■■ 4.49
RSF1Q96T23 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
RSF1Q96T23 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
RSF1Q96T23 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC43.08■■■■■ 4.49
RSF1Q96T23 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
RSF1Q96T23 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
RSF1Q96T23 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
RSF1Q96T23 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC43.07■■■■■ 4.49
RSF1Q96T23 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC43.07■■■■■ 4.49
RSF1Q96T23 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC43.06■■■■■ 4.48
RSF1Q96T23 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms