Protein–RNA interactions for Protein: Q96T21

SECISBP2, Selenocysteine insertion sequence-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SECISBP2Q96T21 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SECISBP2Q96T21 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SECISBP2Q96T21 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SECISBP2Q96T21 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SECISBP2Q96T21 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SECISBP2Q96T21 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SECISBP2Q96T21 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SECISBP2Q96T21 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SECISBP2Q96T21 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SECISBP2Q96T21 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SECISBP2Q96T21 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SECISBP2Q96T21 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SECISBP2Q96T21 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SECISBP2Q96T21 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SECISBP2Q96T21 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SECISBP2Q96T21 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SECISBP2Q96T21 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SECISBP2Q96T21 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SECISBP2Q96T21 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SECISBP2Q96T21 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SECISBP2Q96T21 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SECISBP2Q96T21 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SECISBP2Q96T21 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SECISBP2Q96T21 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms