Protein–RNA interactions for Protein: Q96RI1

NR1H4, Bile acid receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H4Q96RI1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1H4Q96RI1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms