Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPGRIP1Q96KN7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPGRIP1Q96KN7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPGRIP1Q96KN7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPGRIP1Q96KN7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPGRIP1Q96KN7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPGRIP1Q96KN7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RPGRIP1Q96KN7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RPGRIP1Q96KN7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPGRIP1Q96KN7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPGRIP1Q96KN7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPGRIP1Q96KN7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPGRIP1Q96KN7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPGRIP1Q96KN7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPGRIP1Q96KN7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPGRIP1Q96KN7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPGRIP1Q96KN7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPGRIP1Q96KN7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPGRIP1Q96KN7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPGRIP1Q96KN7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPGRIP1Q96KN7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RPGRIP1Q96KN7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPGRIP1Q96KN7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPGRIP1Q96KN7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPGRIP1Q96KN7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPGRIP1Q96KN7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPGRIP1Q96KN7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPGRIP1Q96KN7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPGRIP1Q96KN7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPGRIP1Q96KN7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPGRIP1Q96KN7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPGRIP1Q96KN7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPGRIP1Q96KN7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms