Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN37Q96GY3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN37Q96GY3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN37Q96GY3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN37Q96GY3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN37Q96GY3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN37Q96GY3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN37Q96GY3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN37Q96GY3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN37Q96GY3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN37Q96GY3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN37Q96GY3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN37Q96GY3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN37Q96GY3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN37Q96GY3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LIN37Q96GY3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LIN37Q96GY3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIN37Q96GY3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN37Q96GY3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN37Q96GY3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN37Q96GY3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIN37Q96GY3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIN37Q96GY3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN37Q96GY3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN37Q96GY3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN37Q96GY3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN37Q96GY3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN37Q96GY3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN37Q96GY3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN37Q96GY3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN37Q96GY3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN37Q96GY3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN37Q96GY3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN37Q96GY3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN37Q96GY3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN37Q96GY3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN37Q96GY3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN37Q96GY3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIN37Q96GY3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LIN37Q96GY3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIN37Q96GY3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIN37Q96GY3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIN37Q96GY3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.8 ms