Protein–RNA interactions for Protein: Q93096

PTP4A1, Protein tyrosine phosphatase type IVA 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A1Q93096 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTP4A1Q93096 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTP4A1Q93096 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTP4A1Q93096 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTP4A1Q93096 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTP4A1Q93096 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTP4A1Q93096 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTP4A1Q93096 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTP4A1Q93096 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTP4A1Q93096 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTP4A1Q93096 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTP4A1Q93096 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTP4A1Q93096 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTP4A1Q93096 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTP4A1Q93096 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTP4A1Q93096 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTP4A1Q93096 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PTP4A1Q93096 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTP4A1Q93096 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTP4A1Q93096 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTP4A1Q93096 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTP4A1Q93096 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTP4A1Q93096 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTP4A1Q93096 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTP4A1Q93096 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTP4A1Q93096 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTP4A1Q93096 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTP4A1Q93096 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTP4A1Q93096 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTP4A1Q93096 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTP4A1Q93096 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms