Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLP1Q92989 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLP1Q92989 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLP1Q92989 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLP1Q92989 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLP1Q92989 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLP1Q92989 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLP1Q92989 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLP1Q92989 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLP1Q92989 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLP1Q92989 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLP1Q92989 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CLP1Q92989 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLP1Q92989 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLP1Q92989 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLP1Q92989 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLP1Q92989 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLP1Q92989 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLP1Q92989 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLP1Q92989 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLP1Q92989 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLP1Q92989 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLP1Q92989 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLP1Q92989 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms