Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NEO1Q92859 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
NEO1Q92859 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
NEO1Q92859 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NEO1Q92859 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NEO1Q92859 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC36.84■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
NEO1Q92859 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
NEO1Q92859 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NEO1Q92859 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NEO1Q92859 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NEO1Q92859 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NEO1Q92859 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NEO1Q92859 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NEO1Q92859 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NEO1Q92859 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
NEO1Q92859 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NEO1Q92859 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
NEO1Q92859 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NEO1Q92859 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NEO1Q92859 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NEO1Q92859 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NEO1Q92859 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NEO1Q92859 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NEO1Q92859 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NEO1Q92859 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
NEO1Q92859 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NEO1Q92859 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
NEO1Q92859 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NEO1Q92859 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
NEO1Q92859 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NEO1Q92859 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NEO1Q92859 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NEO1Q92859 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NEO1Q92859 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NEO1Q92859 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NEO1Q92859 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NEO1Q92859 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NEO1Q92859 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NEO1Q92859 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NEO1Q92859 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NEO1Q92859 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
NEO1Q92859 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
NEO1Q92859 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
NEO1Q92859 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NEO1Q92859 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NEO1Q92859 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NEO1Q92859 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NEO1Q92859 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NEO1Q92859 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NEO1Q92859 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NEO1Q92859 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NEO1Q92859 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NEO1Q92859 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
NEO1Q92859 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
NEO1Q92859 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
NEO1Q92859 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NEO1Q92859 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NEO1Q92859 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NEO1Q92859 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NEO1Q92859 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NEO1Q92859 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NEO1Q92859 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
NEO1Q92859 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
NEO1Q92859 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
NEO1Q92859 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
NEO1Q92859 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
NEO1Q92859 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
NEO1Q92859 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
NEO1Q92859 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms