Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF3Q92576 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF3Q92576 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms