Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMBR1Q8WVP7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LMBR1Q8WVP7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBR1Q8WVP7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBR1Q8WVP7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBR1Q8WVP7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBR1Q8WVP7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBR1Q8WVP7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBR1Q8WVP7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBR1Q8WVP7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBR1Q8WVP7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMBR1Q8WVP7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMBR1Q8WVP7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMBR1Q8WVP7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMBR1Q8WVP7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMBR1Q8WVP7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMBR1Q8WVP7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMBR1Q8WVP7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMBR1Q8WVP7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMBR1Q8WVP7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMBR1Q8WVP7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMBR1Q8WVP7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMBR1Q8WVP7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMBR1Q8WVP7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMBR1Q8WVP7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMBR1Q8WVP7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMBR1Q8WVP7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMBR1Q8WVP7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMBR1Q8WVP7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMBR1Q8WVP7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMBR1Q8WVP7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMBR1Q8WVP7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMBR1Q8WVP7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMBR1Q8WVP7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMBR1Q8WVP7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMBR1Q8WVP7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMBR1Q8WVP7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMBR1Q8WVP7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMBR1Q8WVP7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMBR1Q8WVP7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMBR1Q8WVP7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMBR1Q8WVP7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMBR1Q8WVP7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMBR1Q8WVP7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMBR1Q8WVP7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LMBR1Q8WVP7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMBR1Q8WVP7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMBR1Q8WVP7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMBR1Q8WVP7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMBR1Q8WVP7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMBR1Q8WVP7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMBR1Q8WVP7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMBR1Q8WVP7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LMBR1Q8WVP7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMBR1Q8WVP7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMBR1Q8WVP7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMBR1Q8WVP7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms