Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAU0

NKX2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-3Q8TAU0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NKX2-3Q8TAU0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NKX2-3Q8TAU0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NKX2-3Q8TAU0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NKX2-3Q8TAU0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NKX2-3Q8TAU0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NKX2-3Q8TAU0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NKX2-3Q8TAU0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NKX2-3Q8TAU0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NKX2-3Q8TAU0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NKX2-3Q8TAU0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NKX2-3Q8TAU0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NKX2-3Q8TAU0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NKX2-3Q8TAU0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NKX2-3Q8TAU0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NKX2-3Q8TAU0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NKX2-3Q8TAU0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NKX2-3Q8TAU0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NKX2-3Q8TAU0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NKX2-3Q8TAU0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NKX2-3Q8TAU0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NKX2-3Q8TAU0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NKX2-3Q8TAU0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NKX2-3Q8TAU0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NKX2-3Q8TAU0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NKX2-3Q8TAU0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NKX2-3Q8TAU0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NKX2-3Q8TAU0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NKX2-3Q8TAU0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NKX2-3Q8TAU0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NKX2-3Q8TAU0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NKX2-3Q8TAU0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NKX2-3Q8TAU0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NKX2-3Q8TAU0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NKX2-3Q8TAU0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NKX2-3Q8TAU0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NKX2-3Q8TAU0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NKX2-3Q8TAU0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NKX2-3Q8TAU0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NKX2-3Q8TAU0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NKX2-3Q8TAU0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NKX2-3Q8TAU0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NKX2-3Q8TAU0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NKX2-3Q8TAU0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NKX2-3Q8TAU0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NKX2-3Q8TAU0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NKX2-3Q8TAU0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NKX2-3Q8TAU0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NKX2-3Q8TAU0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NKX2-3Q8TAU0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NKX2-3Q8TAU0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NKX2-3Q8TAU0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NKX2-3Q8TAU0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NKX2-3Q8TAU0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NKX2-3Q8TAU0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NKX2-3Q8TAU0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NKX2-3Q8TAU0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NKX2-3Q8TAU0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NKX2-3Q8TAU0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NKX2-3Q8TAU0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NKX2-3Q8TAU0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NKX2-3Q8TAU0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NKX2-3Q8TAU0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms