Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXA5

SPACA3, Sperm acrosome membrane-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA3Q8IXA5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPACA3Q8IXA5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPACA3Q8IXA5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPACA3Q8IXA5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPACA3Q8IXA5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPACA3Q8IXA5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPACA3Q8IXA5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPACA3Q8IXA5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPACA3Q8IXA5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPACA3Q8IXA5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPACA3Q8IXA5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPACA3Q8IXA5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPACA3Q8IXA5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPACA3Q8IXA5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPACA3Q8IXA5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPACA3Q8IXA5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPACA3Q8IXA5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPACA3Q8IXA5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPACA3Q8IXA5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPACA3Q8IXA5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPACA3Q8IXA5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 240.4 ms