Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS6

RAB43, Ras-related protein Rab-43, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB43Q86YS6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB43Q86YS6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB43Q86YS6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB43Q86YS6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms