Protein–RNA interactions for Protein: Q86YH6

PDSS2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS2Q86YH6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDSS2Q86YH6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDSS2Q86YH6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDSS2Q86YH6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDSS2Q86YH6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDSS2Q86YH6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDSS2Q86YH6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDSS2Q86YH6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDSS2Q86YH6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDSS2Q86YH6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDSS2Q86YH6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms