Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP34Q70CQ2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP34Q70CQ2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
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