Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR62

RTL4, Retrotransposon Gag-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL4Q6ZR62 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RTL4Q6ZR62 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTL4Q6ZR62 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTL4Q6ZR62 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms