Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUC0

TFAP2E, Transcription factor AP-2-epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2EQ6VUC0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFAP2EQ6VUC0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFAP2EQ6VUC0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFAP2EQ6VUC0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms