Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATRNL1Q5VV63 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATRNL1Q5VV63 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATRNL1Q5VV63 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATRNL1Q5VV63 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATRNL1Q5VV63 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATRNL1Q5VV63 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATRNL1Q5VV63 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATRNL1Q5VV63 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATRNL1Q5VV63 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATRNL1Q5VV63 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATRNL1Q5VV63 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATRNL1Q5VV63 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATRNL1Q5VV63 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATRNL1Q5VV63 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ATRNL1Q5VV63 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATRNL1Q5VV63 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATRNL1Q5VV63 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ATRNL1Q5VV63 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATRNL1Q5VV63 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATRNL1Q5VV63 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATRNL1Q5VV63 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATRNL1Q5VV63 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATRNL1Q5VV63 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATRNL1Q5VV63 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms