Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HES3Q5TGS1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms