Protein–RNA interactions for Protein: Q5JR12

PPM1J, Protein phosphatase 1J, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1JQ5JR12 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPM1JQ5JR12 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPM1JQ5JR12 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1JQ5JR12 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms