Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C3orf38Q5JPI3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C3orf38Q5JPI3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C3orf38Q5JPI3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms