Protein–RNA interactions for Protein: Q59EK9

RUNDC3A, RUN domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3AQ59EK9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RUNDC3AQ59EK9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC3AQ59EK9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms