Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GREB1Q4ZG55 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms