Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCF4Q15080 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCF4Q15080 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCF4Q15080 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCF4Q15080 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCF4Q15080 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCF4Q15080 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NCF4Q15080 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NCF4Q15080 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCF4Q15080 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCF4Q15080 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCF4Q15080 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCF4Q15080 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCF4Q15080 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCF4Q15080 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NCF4Q15080 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCF4Q15080 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCF4Q15080 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCF4Q15080 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCF4Q15080 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCF4Q15080 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCF4Q15080 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCF4Q15080 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCF4Q15080 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCF4Q15080 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCF4Q15080 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCF4Q15080 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCF4Q15080 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCF4Q15080 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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