Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A4Q13733 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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