Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD4Q13485 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD4Q13485 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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