Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK2Q13002 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK2Q13002 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK2Q13002 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK2Q13002 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK2Q13002 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK2Q13002 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK2Q13002 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK2Q13002 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK2Q13002 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK2Q13002 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK2Q13002 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK2Q13002 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK2Q13002 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK2Q13002 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK2Q13002 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK2Q13002 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK2Q13002 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK2Q13002 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK2Q13002 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK2Q13002 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK2Q13002 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK2Q13002 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK2Q13002 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK2Q13002 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK2Q13002 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK2Q13002 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIK2Q13002 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIK2Q13002 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIK2Q13002 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GRIK2Q13002 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GRIK2Q13002 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK2Q13002 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
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