Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCBP1Q09161 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCBP1Q09161 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms