Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBE1Q04446 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBE1Q04446 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GBE1Q04446 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBE1Q04446 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBE1Q04446 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBE1Q04446 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBE1Q04446 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBE1Q04446 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GBE1Q04446 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBE1Q04446 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBE1Q04446 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GBE1Q04446 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBE1Q04446 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBE1Q04446 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBE1Q04446 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBE1Q04446 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBE1Q04446 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBE1Q04446 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBE1Q04446 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBE1Q04446 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBE1Q04446 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBE1Q04446 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBE1Q04446 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBE1Q04446 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GBE1Q04446 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBE1Q04446 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBE1Q04446 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBE1Q04446 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GBE1Q04446 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBE1Q04446 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms