Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OC90Q02509 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OC90Q02509 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OC90Q02509 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OC90Q02509 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OC90Q02509 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OC90Q02509 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OC90Q02509 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OC90Q02509 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OC90Q02509 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
OC90Q02509 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OC90Q02509 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OC90Q02509 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OC90Q02509 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OC90Q02509 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
OC90Q02509 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OC90Q02509 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OC90Q02509 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OC90Q02509 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OC90Q02509 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OC90Q02509 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OC90Q02509 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OC90Q02509 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OC90Q02509 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OC90Q02509 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OC90Q02509 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OC90Q02509 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OC90Q02509 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
OC90Q02509 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
OC90Q02509 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OC90Q02509 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OC90Q02509 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OC90Q02509 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
OC90Q02509 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OC90Q02509 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OC90Q02509 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OC90Q02509 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OC90Q02509 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OC90Q02509 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OC90Q02509 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OC90Q02509 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OC90Q02509 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OC90Q02509 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
OC90Q02509 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OC90Q02509 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OC90Q02509 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OC90Q02509 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OC90Q02509 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OC90Q02509 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OC90Q02509 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OC90Q02509 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OC90Q02509 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OC90Q02509 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OC90Q02509 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OC90Q02509 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OC90Q02509 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OC90Q02509 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OC90Q02509 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OC90Q02509 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OC90Q02509 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OC90Q02509 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OC90Q02509 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OC90Q02509 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OC90Q02509 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OC90Q02509 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OC90Q02509 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OC90Q02509 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OC90Q02509 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OC90Q02509 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
OC90Q02509 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OC90Q02509 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OC90Q02509 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OC90Q02509 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
OC90Q02509 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OC90Q02509 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OC90Q02509 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OC90Q02509 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
OC90Q02509 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
OC90Q02509 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OC90Q02509 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OC90Q02509 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OC90Q02509 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OC90Q02509 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OC90Q02509 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OC90Q02509 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OC90Q02509 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OC90Q02509 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OC90Q02509 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OC90Q02509 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OC90Q02509 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OC90Q02509 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OC90Q02509 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OC90Q02509 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OC90Q02509 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OC90Q02509 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OC90Q02509 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OC90Q02509 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OC90Q02509 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OC90Q02509 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OC90Q02509 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms