Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CLTCQ00610 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CLTCQ00610 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CLTCQ00610 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CLTCQ00610 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CLTCQ00610 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CLTCQ00610 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CLTCQ00610 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CLTCQ00610 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CLTCQ00610 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CLTCQ00610 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
CLTCQ00610 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CLTCQ00610 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CLTCQ00610 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CLTCQ00610 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CLTCQ00610 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CLTCQ00610 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CLTCQ00610 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CLTCQ00610 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CLTCQ00610 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CLTCQ00610 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CLTCQ00610 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
CLTCQ00610 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
CLTCQ00610 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CLTCQ00610 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
CLTCQ00610 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CLTCQ00610 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CLTCQ00610 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CLTCQ00610 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CLTCQ00610 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CLTCQ00610 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CLTCQ00610 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
CLTCQ00610 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CLTCQ00610 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CLTCQ00610 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
CLTCQ00610 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CLTCQ00610 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CLTCQ00610 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CLTCQ00610 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CLTCQ00610 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CLTCQ00610 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CLTCQ00610 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CLTCQ00610 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CLTCQ00610 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CLTCQ00610 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
CLTCQ00610 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CLTCQ00610 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CLTCQ00610 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CLTCQ00610 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CLTCQ00610 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CLTCQ00610 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CLTCQ00610 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
CLTCQ00610 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CLTCQ00610 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CLTCQ00610 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CLTCQ00610 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CLTCQ00610 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CLTCQ00610 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CLTCQ00610 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CLTCQ00610 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CLTCQ00610 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CLTCQ00610 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CLTCQ00610 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CLTCQ00610 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
CLTCQ00610 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CLTCQ00610 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CLTCQ00610 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CLTCQ00610 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLTCQ00610 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
CLTCQ00610 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CLTCQ00610 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CLTCQ00610 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CLTCQ00610 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CLTCQ00610 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CLTCQ00610 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CLTCQ00610 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CLTCQ00610 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CLTCQ00610 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CLTCQ00610 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CLTCQ00610 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CLTCQ00610 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
CLTCQ00610 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CLTCQ00610 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
CLTCQ00610 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CLTCQ00610 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CLTCQ00610 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CLTCQ00610 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
CLTCQ00610 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CLTCQ00610 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CLTCQ00610 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CLTCQ00610 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CLTCQ00610 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
CLTCQ00610 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CLTCQ00610 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CLTCQ00610 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CLTCQ00610 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CLTCQ00610 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CLTCQ00610 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CLTCQ00610 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CLTCQ00610 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms