Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPS29P62273 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS29P62273 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS29P62273 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS29P62273 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS29P62273 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS29P62273 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS29P62273 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS29P62273 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS29P62273 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS29P62273 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS29P62273 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS29P62273 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS29P62273 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS29P62273 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS29P62273 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS29P62273 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS29P62273 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS29P62273 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS29P62273 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS29P62273 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS29P62273 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPS29P62273 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RPS29P62273 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RPS29P62273 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPS29P62273 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPS29P62273 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPS29P62273 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPS29P62273 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPS29P62273 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPS29P62273 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPS29P62273 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPS29P62273 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPS29P62273 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RPS29P62273 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPS29P62273 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPS29P62273 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPS29P62273 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPS29P62273 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPS29P62273 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPS29P62273 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPS29P62273 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPS29P62273 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPS29P62273 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPS29P62273 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPS29P62273 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPS29P62273 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPS29P62273 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPS29P62273 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPS29P62273 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPS29P62273 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPS29P62273 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RPS29P62273 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPS29P62273 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RPS29P62273 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPS29P62273 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPS29P62273 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPS29P62273 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPS29P62273 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RPS29P62273 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPS29P62273 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPS29P62273 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPS29P62273 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPS29P62273 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPS29P62273 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RPS29P62273 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPS29P62273 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RPS29P62273 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPS29P62273 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPS29P62273 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPS29P62273 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPS29P62273 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RPS29P62273 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPS29P62273 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPS29P62273 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPS29P62273 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPS29P62273 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPS29P62273 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RPS29P62273 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPS29P62273 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPS29P62273 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPS29P62273 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPS29P62273 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPS29P62273 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPS29P62273 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPS29P62273 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPS29P62273 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPS29P62273 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPS29P62273 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RPS29P62273 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RPS29P62273 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RPS29P62273 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPS29P62273 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPS29P62273 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPS29P62273 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPS29P62273 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPS29P62273 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPS29P62273 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPS29P62273 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPS29P62273 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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