Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVFRD-1P60508 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVFRD-1P60508 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVFRD-1P60508 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms