Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NRLP54845 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRLP54845 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRLP54845 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NRLP54845 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRLP54845 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRLP54845 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRLP54845 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRLP54845 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRLP54845 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRLP54845 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRLP54845 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRLP54845 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRLP54845 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRLP54845 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRLP54845 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRLP54845 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRLP54845 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRLP54845 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRLP54845 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRLP54845 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRLP54845 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRLP54845 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRLP54845 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRLP54845 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRLP54845 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NRLP54845 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRLP54845 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRLP54845 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRLP54845 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRLP54845 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRLP54845 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRLP54845 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRLP54845 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRLP54845 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRLP54845 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRLP54845 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NRLP54845 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NRLP54845 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRLP54845 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRLP54845 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRLP54845 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRLP54845 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRLP54845 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NRLP54845 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRLP54845 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRLP54845 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRLP54845 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRLP54845 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRLP54845 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRLP54845 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRLP54845 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRLP54845 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRLP54845 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRLP54845 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRLP54845 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRLP54845 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRLP54845 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRLP54845 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRLP54845 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRLP54845 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NRLP54845 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRLP54845 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRLP54845 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRLP54845 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRLP54845 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRLP54845 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRLP54845 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRLP54845 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRLP54845 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRLP54845 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRLP54845 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRLP54845 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRLP54845 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRLP54845 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NRLP54845 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRLP54845 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRLP54845 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRLP54845 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NRLP54845 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRLP54845 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRLP54845 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRLP54845 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRLP54845 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NRLP54845 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NRLP54845 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NRLP54845 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NRLP54845 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NRLP54845 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NRLP54845 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRLP54845 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRLP54845 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRLP54845 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRLP54845 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRLP54845 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRLP54845 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRLP54845 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRLP54845 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRLP54845 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRLP54845 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms