Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGDP52209 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGDP52209 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGDP52209 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGDP52209 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGDP52209 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGDP52209 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGDP52209 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGDP52209 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGDP52209 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGDP52209 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGDP52209 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGDP52209 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGDP52209 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGDP52209 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGDP52209 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGDP52209 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGDP52209 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGDP52209 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGDP52209 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGDP52209 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGDP52209 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGDP52209 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGDP52209 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGDP52209 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGDP52209 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGDP52209 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGDP52209 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGDP52209 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PGDP52209 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGDP52209 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGDP52209 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGDP52209 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGDP52209 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGDP52209 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGDP52209 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGDP52209 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGDP52209 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGDP52209 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGDP52209 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGDP52209 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGDP52209 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGDP52209 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PGDP52209 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGDP52209 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGDP52209 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGDP52209 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGDP52209 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGDP52209 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGDP52209 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGDP52209 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGDP52209 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGDP52209 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGDP52209 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGDP52209 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGDP52209 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGDP52209 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGDP52209 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGDP52209 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGDP52209 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGDP52209 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGDP52209 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PGDP52209 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGDP52209 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGDP52209 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGDP52209 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGDP52209 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGDP52209 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGDP52209 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGDP52209 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGDP52209 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGDP52209 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGDP52209 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGDP52209 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGDP52209 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PGDP52209 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGDP52209 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGDP52209 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGDP52209 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGDP52209 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGDP52209 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGDP52209 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGDP52209 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGDP52209 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGDP52209 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGDP52209 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGDP52209 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PGDP52209 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGDP52209 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGDP52209 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGDP52209 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGDP52209 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGDP52209 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PGDP52209 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGDP52209 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGDP52209 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGDP52209 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGDP52209 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGDP52209 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGDP52209 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms