Protein–RNA interactions for Protein: P49682

CXCR3, C-X-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR3P49682 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXCR3P49682 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCR3P49682 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CXCR3P49682 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms